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cDNA合成逆转录混合蛋白检测

更新时间:2025-11-15

逆转录酶是存在于RNA病毒体内的依赖RNA的DNA聚合酶。RT-PCR实验中的逆转录酶需要具有以下二种活性:依赖RNA的DNA聚合酶活性:以RNA为模板合成cDNA的首先条链。依赖DNA的DNA聚合酶活性:以一条DNA链为模板合成互补的双链DNA。在选择逆转录酶时,建议选择无RNaseH①活性(RNaseH-)的逆转录酶。具有RNaseH活性的逆转录酶的RNaseH活性会与聚合酶活性竞争RNA模板与DNA引物(或cDNA延伸链)形成的杂合链,并降解杂合链中的RNA链。被RNaseH活性所降解的RNA模板不能再作为合成cDNA的有效底物,降低了cDNA合成的产量与长度。逆转录反应首先需要逆转录酶的反应活性。cDNA合成逆转录混合蛋白检测

逆转录实验过程中要注意RNA样品的保存、纯化、处理和转录酶的选择,逆转录实验前要对反应体系进行无RNA和无反转录酶的对照。多逆转录酶都具有多种酶活性,主要包括以下几种活性。①RNA指导的DNA聚合酶活性;以RNA为模板,催化dNTP聚合成DNA的过程。此酶需要RNA为引物,多为色氨酸的tRNA,在引物tRNA3′-末端以5′→3′方向合成DNA。反转录酶中不具有3′→5′外切酶活性,因此没有校正功能,所以由反转录酶催化合成的DNA出错率比较高。②RNaseH活性;由反转录酶催化合成的cDNA与模板RNA形成的杂交分子,将由RNaseH从RNA5′端水解掉RNA分子。cDNA合成逆转录混合蛋白检测逆转录PCR是较常用的逆转录应用之一。

逆转录过程是病毒的复制形式之一,如RNA病毒中的逆转录病毒,DNA病毒中的拟逆转录病毒的复制均需要经过逆转录。逆转录过程在真核细胞中也同样存在,例如逆转座子和端粒DNA的延长均存在逆转录过程,需逆转录酶的催化,端粒酶即为真核细胞中的逆转录酶。逆转录过程的揭示是分子生物学研究中的重大发现,是对中心法则的重要修正和补充。人们通过体外模拟该过程,以样本中提取的mRNA为模板,在逆转录酶的作用下,合成出互补的cDNA,构建cDNA文库,并从中筛选特异的目的基因。该方法已成为基因工程技术中较常用的获得目的基因的策略之一。

miRNA的加尾法逆转录和qPCR,miRNA加尾法逆转录:增加miRNA逆转录产物长度较直接的方法就是增加miRNA的长度,即在miRNA的3端后面添加一段序列,然后进行逆转录反应。因此,加尾法是由两个酶共同作用完成的,它们分别是PolyA聚合酶和逆转录酶。PolyA聚合酶负责给miRNA加上PolyA尾,增加其长度。之后逆转录引物结合到PolyA序列上,由逆转录酶完成加长版cDNA的合成。miRNA的加尾法逆转录和qPCR中的qPCR:miRNA荧光定量PCR的过程跟普通mRNA的相似,但由于加尾法逆转录产物的5端均为通用序列,因此其qPCR反向引物都是相同的(通用引物R),不同的是根据miRNA序列设计的正向引物。正向引物的特异性就变得非常重要。对于内参,生工生物的miRNA加尾法首先链cDNA合成试剂盒(B532451)中内置了内参U6的正向引物,使用该引物与通用引物R即可进行内参U6的扩增。逆转录活性可以RNA为模板,合成与其序列互补的DNA链,生成DNA-RNA杂合双链。

多逆转录酶都具有多种酶活性,DNA指导的DNA聚合酶活性;以反转录合成的首先条DNA单链为模板,以dNTP为底物,再合成第二条DNA分子。除此之外,有些反转录酶还有DNA内切酶活性,这可能与病毒基因整合到宿主细胞染色体DNA中有关。反转录酶的发现对于遗传工程技术起了很大的推动作用,目前它已成为一种重要的工具酶。用组织细胞提取mRNA并以它为模板,在反转录酶的作用下,合成出互补的DNA(cDNA),由此可构建出cDNA文库(cDNalibrary),从中筛选特异的目的基因,这是在基因工程技术中较常用的获得目的基因的方法。逆转录实验可以选择加入RNA合成抑制剂RNAse防止RNA降解和污染。cDNA合成逆转录混合蛋白检测

逆转录PCR反应过程中要注意反应管中溶液面积不宜过高,避免泡沫问题。cDNA合成逆转录混合蛋白检测

miRNA逆转录茎环法:首先需要进行RNA样品制备,可选的方法有:离心柱法抽提(不必去除gDNA);传统Trizol法抽提(需要去除gDNA)。miRNA正向引物:需要分别设计。是否采用通用引物视情况而定,正向引物与通用反向引物不会形成二聚体时才能用。取200ul的PCR管,根据所得每组RNA的浓度C,每孔加入1000ng总RNA,按公式1000ng/C计算出所需RNA的体积x。然后按建议的20μL反应体系说明,依次向200μL的PCR管内加入下列试剂:加样结束后,移液器吹打混匀,低速离心数秒。将逆转录PCR管放入PCR扩增仪内,调整参数:37℃15min(反转录反应),85℃5s(反转录酶的失活反应),4℃∞。反应结束后根据实验需要进行荧光定量PCR或放入-20℃冰箱保存。说明:此处可以选择U6下游引物作为U6的逆转录引物,注意相应地调整无酶水的体积和反应温度。cDNA合成逆转录混合蛋白检测

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